Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nme3Q9WV85 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms