Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUA2

Farsb, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsbQ9WUA2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FarsbQ9WUA2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms