Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf13bQ9WU72 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms