Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkraQ9WTX2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms