Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mmp16Q9WTR0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms