Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trpc2Q9R244 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trpc2Q9R244 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms