Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms