Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vav3Q9R0C8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vav3Q9R0C8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms