Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM0

Ubqln2, Ubiquilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln2Q9QZM0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln2Q9QZM0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln2Q9QZM0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms