Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tnnt3Q9QZ47 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms