Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnip3Q9QXT8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms