Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ChmQ9QXG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ChmQ9QXG2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms