Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rai2Q9QVY8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms