Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms