Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk1eQ9JMK2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms