Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc4apQ9JLV2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms