Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chrac1Q9JKP8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms