Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Mrpl39Q9JKF7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms