Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Riox1Q9JJF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Riox1Q9JJF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Riox1Q9JJF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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