Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc12a4Q9JIS8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a4Q9JIS8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms