Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc22Q9JIG7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc22Q9JIG7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms