Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod3Q9JHJ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms