Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn12Q9ET43 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn12Q9ET43 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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