Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn19Q9ET38 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn19Q9ET38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms