Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim39Q9ESN2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms