Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndel1Q9ERR1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms