Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Slc28a3Q9ERH8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Slc28a3Q9ERH8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc28a3Q9ERH8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc28a3Q9ERH8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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