Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dap3Q9ER88 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dap3Q9ER88 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms