Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn2Q9ER65 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn2Q9ER65 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms