Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Stx12Q9ER00 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms