Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rapgef4Q9EQZ6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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