Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpgrip1Q9EPQ2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms