Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SyncQ9EPM5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms