Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne8Q9DC53 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cpne8Q9DC53 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms