Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hmg20aQ9DC33 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hmg20aQ9DC33 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hmg20aQ9DC33 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hmg20aQ9DC33 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmg20aQ9DC33 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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