Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fundc1Q9DB70 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fundc1Q9DB70 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms