Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Pop5Q9DB28 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pop5Q9DB28 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms