Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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