Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc89Q9DA73 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc89Q9DA73 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms