Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Subh2bvQ9D9Z7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms