Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rsph9Q9D9V4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph9Q9D9V4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms