Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9D8N1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9D8N1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms