Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms