Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capn9Q9D805 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Capn9Q9D805 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms