Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc94Q9D6J3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms