Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rab11fip1Q9D620 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Rab11fip1Q9D620 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab11fip1Q9D620 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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