Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn11Q9D572 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms