Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efhd1Q9D4J1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Efhd1Q9D4J1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms