Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph14Q9D3W1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph14Q9D3W1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms