Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tssk3Q9D2E1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms